亳州是漢代著名醫學家華佗的故鄉,享有“藥都”之譽。它與河南禹州(今禹縣)、輝州(今輝縣)、河北祁州(今安國縣)并稱四大藥都,是中國四大藥材集散地之一。清末,亳州已經成了藥商云集,這里盛產中藥材,藥材市場由來已久。主要品種有亳芍、亳菊、亳花粉、亳桑皮等。
亳州擁有全國最大的中藥材市場——中國藥材交易中心于1994年建成。在交易中心上市的藥材品種多達2000余種。每年大量的藥商云集在此。到亳州,可買點具有保健功效的中藥材,烹飪提味或是饋贈親友都很適宜。與藥材中心相配套的中國中藥材期貨交易所、中國中藥材信息中心近年來,在亳州陸續建立起來。1995年,江澤民總書記欣然為亳州題詞:“華佗故里,藥材之鄉”。
同時,亳州所產的國宴用酒“古井貢酒”享譽九州,馳名中外。近年還建成了中國酒文化博物館,展品豐富,陳列考究,充分表現出中國酒文化的博大精深,源遠流長;亳州下轄的蒙城縣擁有中國最大的良種牛產地;毫州剪紙獨具特色,融合了中國南北方剪紙藝術的風格;亳州土特產還有義門苔干、銅關粉皮、觀堂大蒜、蘇趙梨、萬壽綢被面、狗皮褥子、布鞋等,在市區地特產店可生產地和各廣大商場都能很方便的購買到。